曾经有一场大规模的战争叫做“吉尔战争”。战争结束后大约300年过去了。地球圈到目前为止已经失去了它的统治机构，在新的统治体系下，一个新的世界已经建立起来。暂时的和平到来了，与此同时，远离地球的火星圈点燃了新的战争之火。主角少年孙日月·奥古斯都从私人警察公司凯尔西安保公司（以下简称CGS）接受了年轻女孩库德里亚·拉娜·伯恩斯坦的护送任务，她打算在地球部队的统治下使火星城市独立。然而，CGS遭到了一个武装组织Galal Horn的袭击，该组织发现了叛乱的萌芽，因此在使用这些儿童作为诱饵三天后撤退。青少年领袖奥尔加·伊兹卡认为这是一个机会，决定举起反旗反对虐待自己的成年人。受奥尔加委托击退加拉尔·霍恩，三日月使用机动战士高达·巴巴托斯向敌人发起挑战。高达·在“吉尔战争”时期被用作CGS的动力炉。