埃尔里克兄弟生活在两个不同的世界，尽最大努力再次相遇。找回了身体却失去了记忆的阿鲁方斯，再次跟随权大师修炼炼丹，继续寻找哥哥的旅程。1923年，当一场世界大战即将爆发时，爱德华穿过大门来到了德国慕尼黑。在这个现实世界中，爱德华无法使用自己擅长的炼金术，只好在一个长得像他哥哥的年轻人的帮助下，尝试借助火箭工程的力量回到家乡，可惜找不到头绪。德国一战战败，慕尼黑通货膨胀严重，民怨沸腾。人们秘密地寻找理想的国家香巴拉。Aikalud Haushowah领导的图莱教会是一个寻找香巴拉的组织，希望通过结合自然科学打开香巴拉之路，创建一个专属的单一民族国家。爱德华和后来遇到了一个名叫马布泽的人，他正在寻找一条传说中的龙。爱德华和马布兹来到一个陌生的古城，终于见到了这条龙，但原来它是一个人造人韦恩，无法变回他的真实身体。两支强队相遇，展开了一系列激烈的战斗。另一方面，秘密组织图莱教会通过使用韦恩和爱德华画的炼金术阵列，成功地打开了连接炼金术世界和现实世界的大门。两个世界意外相连，让炼金术界陷入了巨大的危机。两兄弟相见的夙愿与前所未有的世界危机交织在一起。埃尔里克兄弟如何面对这种全新的局面？