许多年前，野心勃勃、一心统治宇宙的黑暗皇帝危害了环境，破坏了和平。宇宙之主北斗七星王为了阻止他，在一场激烈的宇宙大战后，终于将暗皇冰冻在地球极地冰岩之下，与世隔绝。
　　为了防止黑暗大帝破解封印，在冰封黑暗大帝之后，北斗星王在地球高僧的指引下发现了地球六只神兽，用北斗星能量和技术制造了六只神兽金刚，并把他的儿子麒麟王和他的守护精灵小精灵留守在地球上。这六只神兽金刚分别是麒麟金刚、青龙金刚、白虎金刚、玄武金刚、朱雀金刚和鹰龙金刚。只有六位超异能的小孩才能驾驭这六件神兽金刚，继而组合成威力无比、象征爱和正义的神兽金刚，保护地球的和平与守护人间的正义。
小精灵找到了地球上最聪明的科学家胡博士，胡博士养了这些猛兽，金刚。胡博士建立了长城科学院，成为保护地球、守护正义、防止坏人入侵的基地。胡博士和他的助手周先生先后发现了6名超常儿童，周先生在长城科学院负责培养和照顾他们。
　　随着的地球温室效应的影响，冰封黑暗大帝的冰岩不断融化，黑暗大帝能量逐渐得到了恢复，并指挥他的残余部下铁面将军准备消灭神兽金刚、破解封印。因此，铁面将军不断命令他的手下玄冥二怪（玄冥黑怪、玄冥白怪）和复仇女将地球上的生物通过改变它们的基因使其变异为巨大的机械兽，然后让怪兽或破坏地球、危害人类，或直接到长城科学院攻打神兽金刚，寻找破解封印的方法。
面对强悍将军制造的机械兽，六子没有退缩，没有退缩。他们用爱和正义的力量，一次又一次地挫败了暗皇和强悍将军的阴谋和计划，最终将暗皇再次冰封在冰山之下。《兽金刚》展现了积极乐观的团队合作精神、可贵的友谊和张扬正义的力量。
　　铁面将军如何变种怪兽的？怪兽的样子又是怎样的？变种怪兽后的动物结局如何？神兽金刚有什么功夫，有什么法宝？它是如何击败怪兽的？
故事从铁面将军一次次解救暗皇并创造机械兽攻击神兽金刚开始...